那兩個鹼基對之間是兩個氫鍵

A與T或A與U之間是兩個氫鍵，G與C之間是三個氫鍵。

氫原子與電負性大、半徑小的原子X以共價鍵結合，若與電負性大的原子Y接近，在X與Y之間以氫為媒介，生成一種特殊的分子間或分子內相互作用，稱為氫鍵。

2013年11月22日，中科院國家納米科學中心宣佈，該中心科研人員在國際上首次拍到氫鍵的照片，實現了氫鍵的實空間成像，為氫鍵的本質這一化學界爭論了80多年的問題提供了直觀證據。這不僅將人類對微觀世界的認識向前推進了一大步，也為在分子、原子尺度上的研究提供了更精確的方法。